Date / Heure : jeudi, 28 mars 2024 à 09:00

Local : 2135

Zoom : https://umontreal.zoom.us/j/89503563588?pwd=ZWVaM2UrNENKV0NZOFh0N2lEamdpZz09

Meeting ID: 895 0356 3588

Passcode: 153243

Titre de la thèse :

Prévalence, description et facteurs de risque de l’antibiorésistance dans les fermes québécoises de bovins laitiers

Résumé :

La résistance aux antimicrobiens (RAM) est un problème de santé publique mondial avec des répercussions importantes en médecine vétérinaire et humaine. La prévalence générale de la RAM, la transmission de ces bactéries résistantes et les facteurs de risque associés à leurs excrétions fécales par les bovins laitiers sont actuellement peu documentés dans les fermes du Québec. L’objectif général de cette thèse était d’explorer la RAM par une étude transversale observationnelle sur des fermes québécoises de bovins laitiers sélectionnées aléatoirement (n = 101). Pour décrire la prévalence de cette RAM, la bactérie Escherichia coli a été isolée des matières fécales des animaux (vaches en lactation, veaux pré-sevrage) et de l’environnement (fosse à fumier). La RAM était faible (<5%) pour les antimicrobiens de très haute importance en médecine humaine (céphalosporines de 3^e génération et fluoroquinolones). Cependant, elle était particulièrement importante pour les E. coli isolés chez les veaux pré-sevrage. Avec le séquençage du génome entier, il a été possible d’expliquer la grande majorité de la RAM (>95%) par des mutations ou des gènes de résistance. Certains de ceux-ci étaient à proximité l’un de l’autre et leur configuration laissait supposer qu’une partie de ces gènes étaient présents sur des éléments génétiques mobiles. De plus, il y avait une dissémination clonale de E. coli résistant entre les fermes. Grâce à des analyses multivariées utilisant l’intelligence artificielle, il a été possible d’observer des facteurs de risque significatifs associés à la taille de la ferme et à la santé des animaux. Bref, un portrait de la situation de la RAM est maintenant établi dans les troupeaux de bovins laitiers du Québec. Il s’agit d’un phénomène complexe qui ne se limite pas simplement à un lien direct avec l’utilisation des antimicrobiens.

Mots-clés :

Résistance aux antimicrobiens, Escherichia coli, Gène de résistance, Clone, Ferme laitière

Jury

• Président-rapporteur : Gustavo Zamberlam
• Directrice : Marie Archambault
• Codirecteurs : Simon Dufour, David Francoz
• Membre du jury : Juan Carlos Arango Sabogal
• Exam. Ext. : Aurélien Madouasse