English version follows. 

Titre du projet. Évaluation du transfert plasmidique entre souches de Clostridium perfringens d’origine aviaire.

Description du projet. L'entérite nécrotique (EN), causée par C. perfringens, est devenue une préoccupation dans les élevages de poulets de chair depuis le retrait des antibiotiques utilisés pour fin de promotion de la croissance. Plus récemment, notre équipe a démontré que le poulet de chair constituait également un réservoir de souches entérotoxinogènes de C. perfringens, responsables de toxi-infections alimentaires chez l'humain (TIA). Ce projet de maîtrise cherchera à déterminer si les larges plasmides conjugatifs retrouvés chez les souches aviaires, qui portent notamment le gène netB codant la toxine NetB (EN) et le gène cpe codant l'entérotoxine (TIA), peuvent être transférés entre souches, afin de mieux comprendre l'émergence de nouveaux variants pathogènes à l'interface entre la santé animale et la santé publique.

Objectifs

L’objectif principal d'évaluer le potentiel de transfert des plasmides conjugatifs portant les gènes de virulence netB et cpe entre des souches aviaires de C. perfringens responsables de l'EN et de TIA, afin de mieux comprendre les mécanismes favorisant l'émergence de nouveaux variants pathogènes.

Les objectifs spécifiques consistent à i) Évaluer l'efficacité du transfert plasmidique entre souches de C. perfringens d’origine aviaire causant l'EN et des TIA; ii) Caractériser les plasmides transférés et identifier les facteurs génétiques susceptibles d'influencer leur transfert et leur maintien dans les souches réceptrices.

Compétences développées. L’étudiant(e) développera des aptitudes en recherche bibliographique, en épidémiologie, en microbiologie, en biologie moléculaire et en analyses bio-informatiques et statistiques. L’étudiant(e) travaillera en interaction avec les membres de l’équipe de la Chaire de recherche en salubrité des viandes (CRSV), incluant des vétérinaires, des biologistes, des biochimistes et des spécialistes de la bio-informatique. Les travaux seront réalisés dans les laboratoires de la CRSV de la Faculté de médecine vétérinaire (FMV) de l’Université de Montréal.

Profil recherché

• Être admissible à la maîtrise en Sciences vétérinaires à l’Université de Montréal
• Avoir terminé une formation au premier universitaire en biologie, microbiologie, ou l’équivalent
• Connaissances et intérêt en biologie moléculaire
• Bon dossier académique
• Bonne capacité de prise en charge, d’analyse et de synthèse
• Bonne maîtrise du français à l’écrit et à l’oral, bonne compréhension de l’anglais
• Expérience reliée à la production animale, au secteur agro-alimentaire ou aux sciences de l’environnement serait un atout

Institution d’accueil. La Chaire de recherche en salubrité des viandes (CRSV) est une structure de recherche et d’enseignement en salubrité alimentaire et analyse du risque. Elle est formée d’une équipe dynamique incluant 4 chercheurs, 2 personnels de recherche et une dizaine d’étudiants aux cycles supérieurs. Les principaux thèmes de recherche s’intéressent à la salubrité alimentaire, la santé animale, la caractérisation des pathogènes bactériens, l’étude de la résistance aux antimicrobiens, et à la comparaison des écosystèmes microbiens et des interactions bactériennes avec ceux-ci dans une approche de la ferme à la table.

Rémunération. Le travail sera financé par une bourse annuelle de 20 000$ pour une période de deux ans. L’étudiant(e) pourra appliquer à des fonds internes ou externes afin d’obtenir un appui financier supplémentaire.

Début du programme. Les candidat(e)s intéressé(e)s sont encouragé(e)s à faire part de leur intérêt le plus rapidement possible. Le projet est prévu pour démarrer au plus tôt en septembre 2026.

Déposer sa candidature. Veuillez faire parvenir votre application à l’adresse courriel : marie-lou.gaucher@umontreal.ca et joindre les documents suivants:

• Lettre décrivant vos intérêts et qualifications pour le poste (maximum 1 page);
• Curriculum vitae;
• Dernier relevé de notes universitaires;
• Noms et coordonnées de deux personnes pouvant agir à titre de référence.

Marie-Lou Gaucher, DMV, MSc, PhD, McbA
Professeure agrégée Chaire de recherche en salubrité des viandes (CRSV)
Faculté de médecine vétérinaire (FMV)
Université de Montréal
Courriel: marie-lou.gaucher@umontreal.ca
Téléphone: 450-773-8521 poste 0097

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Masters (MSc) Program – Veterinary Sciences (Microbiology)

Project title. Investigating plasmid transfer between Clostridium perfringens strains of avian origin.

Project description. Necrotic enteritis (NE), caused by C. perfringens, has become a major concern in broiler chicken production following the withdrawal of antibiotic growth promoters. More recently, our research group demonstrated that broiler chickens also serve as a reservoir of enterotoxigenic C. perfringens strains responsible for human foodborne illness. This M.Sc. project aims to investigate whether the large conjugative plasmids found in avian C. perfringens strains, including those carrying the netB gene encoding the NetB toxin (NE) and the cpe gene encoding the enterotoxin (foodborne illness), can be transferred between strains, thereby improving our understanding of the emergence of novel pathogenic variants at the animal-human health interface.

Objectives

The main objective of this project aims to evaluate the potential for conjugative transfer of plasmids carrying the netB and cpe virulence genes between avian C. perfringens strains associated with NE and foodborne illness, thereby improving our understanding of the mechanisms underlying the emergence of novel pathogenic variants.

The specific objectives are to: i) Evaluate the efficiency of plasmid transfer between avian C. perfringens strains associated with NE and enterotoxigenic strains responsible for foodborne illness; ii) Characterize the transferred plasmids and identify the genetic factors influencing their transfer and maintenance in recipient strains.

Skills to be developed. The graduate student will develop skills in literature review, epidemiology, microbiology, molecular biology and in bioinformatics and statistical analyses. The student will be working closely with members of the Chaire de recherche en salubrité des viandes (CRSV), consisting of veterinarians, biologists, biochemists and bioinformatics specialists. Research work will be conducted in laboratories of the CRSV.

Profile required

• Must be eligible for admission for a MSc program in Veterinary sciences at the Université de Montréal
• Having completed undergraduate studies in biology, in microbiology or in any equivalent field
• Knowledge and interest in molecular biology
• Good to excellent academic record
• Being self-contained with good analytical ability
• Mastering written and spoken French would be an asset
• Any expertise related to animal production, food science or environmental science would be an advantage

Host institution. The Chaire de recherche en salubrité des viandes (CRSV) is a research and teaching group specialized in food safety and risk analysis. It is a dynamic team comprising 4 researchers, 2 research assistant and a dozen of graduate students. Research projects conducted at the CRSV mainly focus on the caracterization of bacterial pathogens, on the study of antibiotic resistance genes and on the interactions between bacteria and their ecosystems in the farm to the table continuum.

Remuneration. The work will be funded by an annual scholarship of $20,000 for a period of two years. The student may apply for internal or external funds to obtain additional financial support.

Project start. Interested candidates must send their application as soon as possible. The project is scheduled to start as early as September 2026.

Submitting your application. Please send the required documents listed below to: marie-lou.gaucher@umontreal.ca

• Letter of interest specifying your qualifications (maximum 1 page);
• Curriculum vitae;
• Transcript of the last academic record;
• Name and contact information of two referees.

Marie-Lou Gaucher, DMV, MSc, PhD, McbA
Assistant Professor Chaire de recherche en salubrité des viandes (CRSV)
Faculté de médecine vétérinaire (FMV)
Université de Montréal
Email: marie-lou.gaucher@umontreal.ca
Phone: 450-773-8521 ext. 0097