Le centre d’expertise et de recherche clinique en santé et bien-être animal (CERCL) est formé de cinq axes de recherches dont l’antibiogouvernance. Les activités de cet axe sont regroupées sous cinq différents thèmes en collaboration et complémentarité avec les différents experts.

Le centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) a parmi ses axes de recherche la prévention et contrôle des maladies infectieuses à l'interface animal-homme-environnement, dont l’une des thématiques est « Les stratégies alternatives à l'utilisation des antimicrobiens et les impacts en santé publique ».

Le Groupe de recherche sur les maladies infectieuses en production animale ( (GREMIP), l’axe Une seule Santé s’occupe des recherches sur  les risques liés aux maladies infectieuses à l'intersection de la santé animale et de la santé publique (zoonoses et salubrité alimentaire). Développer des stratégie pour réduire la résistance aux antimicrobiens.

Le Groupe de recherche en épidémiologie des zoonoses et santé publique (GREZOSP)  est un rassemblement de chercheurs et d’organisations dont la mission est de promouvoir la recherche sur des problématiques de santé publique et de santé animale au niveau des populations afin d’orienter les actions collectives et les politiques publiques.

Dans les thèmes de recherche du regroupement Op+lait on trouve « Détection, caractérisation et mesure de biosécurité relatives aux agents pathogènes pour réduire leur impact sur le microbiote du lait et minimiser le risque de perte d'innocuité. »