Titre de projet :

Caractérisation de la résistance aux bactériophages chez Escherichia coli pathogène aviaire (APEC)

Contexte :

La colibacillose aviaire, causée par les souches d’Escherichia coli pathogènes aviaires (APEC), demeure l’une des principales causes de mortalité, de saisies à l’abattoir et de pertes économiques dans la production avicole. Dans un contexte de réduction de l’usage des antibiotiques, la phagothérapie s’impose comme une avenue prometteuse pour maîtriser ces infections. Son déploiement se heurte toutefois à un obstacle bien documenté : l’émergence rapide de bactéries résistantes aux phages. Comprendre les mécanismes de cette résistance, sa vitesse d’apparition et les coûts qu’elle impose à la bactérie est essentiel pour concevoir des cocktails de phages robustes et durables.

Description du projet :

Le mouvement d’animaux entre les fermes porcines est considéré comme un des plus importants facteurs de risque pour la transmission des agents infectieux. La production sur plusieurs sites accentue le nombre de mouvements nécessaires à la production porcine. Au Québec, la structure du réseau créé par les différents mouvements demeure très peu décrite tout comme son impact sur la transmission des agents pathogènes, limitant ainsi les recommandations pouvant être émises.

L’objectif du présent projet est de décrire la structure globale du réseau de mouvements associés à l’espèce porcine et d’identifier des éléments critiques pour la propagation des maladies infectieuses.

Superviseurs :

• Antony Vincent, professeur, Département des sciences animales, Université Laval (directeur)
• Martine Boulianne, professeure, Chaire en recherche avicole, Faculté de médecine vétérinaire,
• Université de Montréal (codirectrice)

Milieu :

L’étudiant(e) sera inscrit(e) à la maîtrise en sciences animales de l’Université Laval et bénéficiera d’un environnement de recherche à cheval sur la génomique microbienne et la santé aviaire, avec accès aux plateformes des deux établissements et à un réseau de partenaires de l’industrie avicole.

Profil recherché :

• Baccalauréat (ou diplôme équivalent) en microbiologie, biologie, biochimie, sciences animales, médecine vétérinaire ou dans une discipline connexe;
• Expérience ou intérêt marqué pour la microbiologie expérimentale (culture bactérienne, techniques stériles; la manipulation de phages est un atout);
• Intérêt pour la bioinformatique et l’analyse de données de séquençage;
• Autonomie, rigueur, curiosité scientifique et aptitude au travail en équipe;
• Maîtrise du français et capacité à lire la littérature scientifique en anglais.

Conditions :

• Bourse Mitacs de 20 000 $ par année, pour une durée de deux ans;
• Encadrement conjoint par deux équipes complémentaires;
• Possibilité de présenter les résultats dans des congrès nationaux et internationaux;
• Entrée en fonction : session d’hiver ou d’automne 2027, selon la disponibilité de la personne retenue.

Déposer sa candidature :

Faire parvenir par courriel à antony.vincent@fsaa.ulaval.ca, avec la mention « Maîtrise – résistance aux phages APEC » en objet :

1. Une lettre de présentation (maximum une page) expliquant votre intérêt pour le projet;
2. Un curriculum vitæ.

Les candidatures seront évaluées au fur et à mesure de leur réception, jusqu’à ce que le poste soit pourvu.