Alumni
Mathieu Bellerose
Étudiant à la maîtrise en sciences vétérinaires à la faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal, il détient un Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire de l’Université de Montréal.
| Au cours des dernières années, l’intérêt pour l’étude du microbiote intestinal est de plus en plus présent. Toutefois, toute étude portant directement sur le microbiote intestinal de l’animal est coûteuse et fastidieuse. Afin d’obtenir un modèle in vitro d’étude du microbiote intestinal du porc se rapprochant du modèle animal, il travaille sur la mise au point d’un fermenteur capable de reproduire les conditions physicochimiques (pH, température, niveau d’oxygène) de l’intestin du porc. De plus, le fermenteur utilisera du digestat synthétique comme milieu de culture, se rapprochant encore plus du modèle animal. Il pourra par la suite évaluer l’effet d’additifs ou de pathogènes sur la modulation de ce microbiote intestinal. Les résultats obtenus donneront aux industriels des informations pour la modulation du microbiote ainsi que réduire le portage de Salmonelle, évitant ainsi qu’elle se retrouve sur les viandes à la suite de l’abattage. |
Charlotte Braley
Actuellement étudiante au doctorat (Ph.D., UdeM) en sciences vétérinaires option microbiologie, Charlotte Braley a réalisé son cursus universitaire en France. Après l’obtention d’un Brevet de Technicien Supérieur en Bio analyses et contrôles et d’une licence professionnelle en microbiologie industrielle (Paris), elle a réalisé une maîtrise en Microbiologie Fondamentale et Appliquée (Université de Rennes). Au cours de cette maîtrise, elle a effectué un stage de six mois au sein de la Chaire de recherche en salubrité des viandes de la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal. Son étude portait sur la caractérisation du microbiote de surface de carcasses de porc provenant d’un abattoir au Québec pour déterminer si la contamination microbienne provient majoritairement du microbiote de l’animal (microbiotes différents selon les lots de porcs abattus) ou si les étapes de transformation de l’animal en viande dans l’abattoir sont déterminantes (contaminations croisées majeures au cours du procédé d’abattage).
| Son projet de doctorat se focalise sur la salubrités des viandes (porcs/volailles) et plus particulièrement sur la relation avec le microbiote de surfaces des viandes. Plusieurs projets sont associés à cette thèse. Une première étude porte sur la détermination du microbiote de surface de carcasses de volailles en fonction du statut (positif ou négatif) des échantillons à des agents responsables de toxi-infections alimentaires tels que Salmonella spp, Campylobacter spp ou encore Clostridium perfringens. Une tout autre étude porte sur l’utilisation du microbiote de longes de porc comme signature d’abus de températures. Ce projet a pour but d’évaluer l’effet de la température de stockage sur le microbiote de longes de porcs emballés sous vides destinées à l’expédition/commercialisation. |
Amély Grandmont
Amély Grandmont est diplômée en biochimie de la santé à l'Université de Sherbrooke en 2021. C'est lors d'un stage coopératif dans les laboratoires de la Chaire de recherche en salubrité des viandes qu'elle découvre un intérêt pour la recherche en sciences vétérinaires et décide d'y poursuivre ses études à la maîtrise. Son projet de recherche consiste à caractériser en bioréacteur la dose efficace d'un nouveau probiotique destiné au porc pour limiter la colonisation par Salmonella et la dysbiose intestinale.
| Salmonella est une bactérie pathogène zoonotique présente entre autres dans les aliments provenant du porc. Bien que cette bactérie soit présente chez le porc, peu de méthodes sont efficaces pour le contrôle de ce pathogène à la ferme. Notre étude permettra la diminution de Salmonella, voire l'inhibition de celle-ci dans l'intestin porcin à l'aide d'un nouveau probiotique. Les essais seront effectués à l'aide d'un bioréacteur dans lequel un microbiote porcin dérivé du porc sera utilisé. Cette technologie permettra de tester le probiotique en présence de conditions très similaires à celui du microbiote intestinal normal du porc tout en réduisant le nombre d'animaux utilisés. La diminution de la concentration de Salmonella dans l’intestin porcin permettra d’améliorer la santé globale des porcs tout en diminuant le nombre de cas de salmonellose humaine. |
Rosette Kakese Mukosa
Diplômée en médecine vétérinaire à l’Université de Lubumbashi, République démocratique du Congo en 2017. Elle a été nommée assistante dans ladite Université en 2018. Ayant un intérêt marqué en hygiène, technologie des aliments, ainsi qu’en analyse des risques et contrôle des points critiques (HACCP), elle sollicite en 2019 de faire un stage de formation à l’Université de Montréal, Faculté de Médecine Vétérinaire et cela, dans le cadre d’une bourse Mitacs accélération internationale Canada. Par la suite, elle décide de joindre la Chaire de recherche en salubrité de viandes (CRSV) comme étudiante à la maîtrise dans un projet portant sur la caractérisation du risque associé à la présence de Clostridium perfringens entérotoxinogène chez le poulet de chair.
| Résumé du projet: Clostridium perfringens entérotoxinogène se classe parmi les principales causes de toxi-infections d’origine alimentaire au Canada. Malgré des centaines de milliers de cas de toxi-infections attribuables à ce pathogène chaque année au Canada, les réservoirs et voies de transmission jusqu’à l’humain demeurent très peu documentés. Une étude précédente réalisée dans nos laboratoires et basée sur une détection par PCR a montré que jusqu’à 25% des carcasses de poulets de chair prêtes à la mise en marché pouvaient être contaminées par la bactérie et qu’autant les environnements d’élevage que de transformation des volailles représenteraient une source de la bactérie. Une caractérisation génétique de ces isolats retrouvés tout au long de la chaîne de production de poulets de chair nous permettra alors de mieux décrire les sources de contamination par ce pathogène en filière avicole au Québec. |
Catherine Turcotte
Dre Catherine Turcotte a obtenu son DMV à la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal (UdeM) en 2018. Elle a ensuite joint la CRSV comme étudiante à la maîtrise (M.Sc., UdeM). Ayant un intérêt marqué pour la santé publique et l’antibiorésistance, son projet porte sur l’étude de la résistance aux antibiotiques chez les élevages commerciaux de poulets de chair au Québec.
| La stratégie de réduction des antimicrobiens de l’industrie avicole au Canada démontre le besoin et la volonté d’adresser le problème d’antibiorésistance. Par contre, peu d’études ont évalué le microbiote intestinal et le phénomène de l’antibiorésistance chez les élevages commerciaux de poulets de chair avec une régie conventionnelle (avec antibiotiques) et avec une régie alternative (sans antibiotiques). Cette étude permettra d’évaluer les impacts du retrait des antibiotiques à court terme et la réintroduction de ceux-ci chez des élevages commerciaux de poulets de chair. Les résultats obtenus grâce à cette étude permettront de guider l’industrie avicole face aux présentes réformes qui concernent l’utilisation des antibiotiques. |
Sophie Chagneau
Sophie est arrivée au laboratoire en janvier 2019 pour y effectuer un stage de quatre mois et a par la suite entamé un doctorat en sciences vétérinaires option microbiologie sous la supervision du Pr Alexandre Thibodeau. Sophie a débuté ses études par une Classe Préparatoire aux Grandes Écoles en Biologie, Chimie, Physique et Sciences de la Terre en France. Elle a ensuite obtenu une licence en Biochimie, Biologie Moléculaire et Cellulaire, et Génétique de l’Université de Limoges (France). A l’issu, elle a réalisé un master en Zoonoses et Environnement de l’Université de Limoges (France), au cours duquel elle a réalisé un premier stage sur la détection et la caractérisation génétique d'Anaplasma phagocytophilum chez le chevreuil et le hérisson à l’Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes (France) ; et un deuxième stage sur une méthode in vitro pour accéder à la viabilité et à l’infectiosité des oocystes de Toxoplasma gondii à la Faculté de Médecine de Reims (France). En 2017, elle est arrivée au Canada pour y réaliser un doctorat sur les mécanismes du contrôle traductionnel dans la toxoplasmose congénitale à l’INRS Institut Armand Frappier, qu’elle a finalement arrêté pour se réorienter.
| Elle étudie les interactions entre différentes souches de Campylobacter jejuni lors de la colonisation intestinale des poulets. Sophie réalisera des expérimentations in vitro (interactions directes) et in vivo (interactions indirectes : microbiote intestinal et réponse immunitaire) afin de déterminer comment les différentes souches de C. jejuni entrent en compétition pour la colonisation d’un même hôte. L’ensemble de ce projet permettra de déterminer par quels mécanismes et à quel moment les différentes souches de C. jejuni entrent en compétition afin d’acquérir des connaissances facilitant le développement de mesures de contrôles ciblées à la ferme. |
Sara Heidarpanah
Sara a obtenu son Baccalauréat ès sciences (B.Sc.) de la Faculté de sciences biologiques de l’Université de Alzahra, Tehran, 2013. Elle a par la suite commencé sa maîtrise (M.Sc.) au National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), Tehran, Iran. Elle a obtenu son M.Sc. en décembre 2015. Sa thèse portait sur l’expression en surface des épitopes immunogènes de Clostridium perfringens sur le Bacillus subtilis en utilisant l'enzyme sortase. Elle a commencé son doctorat en September, 2018 à la chaire de recherche en salubrité des viandes de la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal. Sa thèse de Ph.D, sous la supervision de Dre. Marie-Lou Gaucher et les co-directions du Dr. Alexandre Thibodeau, Dr. Sylvain Quessy et Dre. Mariela Segura, porte sur l’évaluation de la capacité immunoprotectrice de protéines recombinantes exposées à la surface provenant de Clostridium perfringens causant l'entérite nécrotique pour le développement d'un vaccin efficace contre l'entérite nécrotique.
| Le Canada a adopté une stratégie nationale visant à éliminer progressivement l'utilisation d'antibiotiques pour prévenir les maladies chez les troupeaux de poulets de chair. Ce retrait des antibiotiques entraînera une résurgence de l'entérite nécrotique aviaire, une maladie digestive mortelle causée par la bactérie Clostridium perfringens, et donc l'impact économique pourrait être dévastateur sur la viabilité de cette industrie dans le pays. Bien qu'aucun vaccin ne soit actuellement disponible, l'utilisation de la vaccinologie inverse aidera à identifier les protéines de surface bactériennes uniques aux souches virulentes de C. perfringens. Au cours de son projet, elle utilisera des techniques de biologie moléculaire pour cloner, produire et purifier des protéines de surface bactériennes déjà identifiées par analyse bioinformatique dans notre groupe. Dans une prochaine étape, elle évaluera l'immunogénicité des protéines recombinantes ainsi que leurs effets sur le microbiote intestinal des poulets. Enfin, elle évaluera les effets protecteurs des protéines recombinantes dans un essai sur des animaux. |
Fanie Shedleur-Bourguignon
Étudiante au doctorat (Ph.D., UdeM) en Sciences vétérinaires option microbiologie, Fanie Shedleur-Bourguignon a obtenu son baccalauréat en Microbiologie et immunologie de la Faculté de Médecine de l’Université de Montréal (B. Sc., UdeM). Elle a par la suite entamé une maîtrise en sciences vétérinaires (M.Sc., UdeM) et réalisé un passage accéléré au doctorat.
| Elle étudie les composants de l’écosystème microbien des surfaces de production de viande porcine associés à la présence ou à l’absence du pathogène Listeria monocytogenes. Cette bactérie est responsable de la listériose, une toxi-infection alimentaire rare, mais pouvant être fatale (taux de mortalité de 30%). Le caractère psychrophile de Listeria monocytogenes et sa capacité à former des biofilms sont des paramètres documentés qui permettent le maintien de la bactérie sur des surfaces de production alimentaires malgré des procédures de nettoyage et de désinfection rigoureuses. Durant le traitement des carcasses, la bactérie peut se détacher des surfaces en contact avec la viande, ce qui peut entraîner la contamination des aliments. Fanie Shedleur-Bourguignon travaille à comprendre la contribution du microbiote associé à L. monocytogenes sur de telles surfaces par des techniques de bio-informatique, de co-cultures planctoniques et de biofilms sous conditions statiques et dynamiques. |
Alexandra Veress
Alexandra Veress a obtenu son PhD en 2021 en génétique classique et moléculaire bactérienne à l’Université Eötvös Loránd (Hongrie). Après un premier stage post-doctoral à l’Université de Sherbrooke où elle a continué à travailler dans le même domaine, soit sur le transfert horizontal de gènes chez les bactéries, elle a tourné son intérêt vers la direction des sciences appliquées. Elle a postulé à la Chaire de recherche en salubrité des viandes, Département de pathologie et microbiologie de l’Université de Montréal pour participer au projet portant sur l’Étude des structures de surface de Clostridium perfringens d’origine aviaire. Elle a rejoint l’équipe de la professeure Marie-Lou Gaucher en juillet 2023.
Résumé du projet: Clostridium perfringens est un pathogène largement répandu qui provoque des maladies humaines et animales. Les souches de type F (productrices d’une entérotoxine), également connues sous le nom de C. perfringens entérotoxinogènes, sont responsables d'épidémies d'origine alimentaire dans le monde. On ne sait toujours pas comment C. perfringens entérotoxinogène entre dans la chaîne alimentaire et le processus de colonisation des animaux par ce pathogène est encore moins compris. Les protéines bactériennes de surface jouent un rôle clé dans la pathogenèse bactérienne et sont essentielles à l'adhésion et à la colonisation des bactéries. Mon projet se concentre sur l'identification et la caractérisation de ces structures de surface chez C. perfringens entérotoxinogène d'origine aviaire, ainsi que sur l'évaluation de la contribution de ces structures bactériennes à l'adhésion de cette espèce bactérienne à l'intestin du poulet de chair et à la stimulation de son système immunitaire. |
Asmaâ Khalloufi
Asmaâ a obtenu son diplôme d’études secondaires (baccalauréat sciences physiques) en 2008 au Lycée princesse Lalla Meryem en Agadir au Maroc. Elle a fait ensuite sa formation en médecine vétérinaire à l’Institut Agronomique et Vétérinaire Hassan II, Rabat, Maroc. En 2015, elle a soutenu sa thèse intitulée Évaluation du programme de lutte contre l’hydatidose dans la préfecture d’Agadir Idaoutanane pour l’obtention de son diplôme. Par la suite, elle a entamé sa carrière professionnelle dans le secteur avicole au Maroc avant de commencer sa maîtrise en mai 2021 à la CRSV. Son projet consiste en la caractérisation du rôle des bioaérosols émis par les environnements de fermes et d’abattoirs de volailles et de porcs dans l’exposition des travailleurs aux gènes de résistance aux antibiotiques au Québec.
| Les élevages et les abattoirs de porcs et de volailles peuvent être des sources d’exposition pour les travailleurs aux gènes de résistance aux antibiotiques transportés par les bioaérosols retrouvés dans ces environnements. Bien que diverses initiatives aient été mises de l’avant au cours des dernières années afin de diminuer l’usage des antibiotiques en production porcine et avicole, ces molécules font toujours partie intégrante du quotidien de ces productions et des bactéries résistantes aux antibiotiques risquent alors d’être véhiculées par les bioaérosols. Cette étude prévoit la caractérisation des bioaérosols et la quantification de certains gènes de résistance aux antibiotiques dans des environnements de production et d’abattage porcins et avicoles. Dans l’objectif de mieux évaluer l’impact sur la santé des travailleurs de ces environnements de production, le profil génétique des bioaérosols retrouvés à l’abattoir sera comparé avec le microbiote nasopharyngé des travailleurs à l’aide d’une approche de séquençage à haut débit. |
