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Alexandre Thibodeau

Vcard

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine vétérinaire - Département de pathologie et microbiologie

3190, rue Sicotte - Pavillon de santé publique vétérinaire office 1101-10

alexandre.thibodeau@umontreal.ca

514 343-6111 #8242

Maîtrise
2007 , Médecine vétérinaire, Microbiologie , Université de Montréal (Canada)

Doctorat
2014 , Médecine vétérinaire, Microbiologie , Université de Montréal (Canada)

Postdoctorat
2016 , Médecine vétérinaire , Chaire de recherche en salubrité des viandes (Canada)

Affiliations

Expertises

Student supervision Expand all Collapse all

Mise au point d'une méthode d'isolement pour la détection de Clostridium perfringens entérotoxinogène chez le poulet de chair Thèses et mémoires dirigés / 2024 - 2024
Graduate : Kakese Mukosa, Rosette
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
L’analyse de la variabilité du microbiote de surface des carcasses et des produits finis de porc comme valeur indicatrice de la salubrité de la viande Thèses et mémoires dirigés / 2023 - 2023
Graduate : Braley, Charlotte
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Mise au point d’un système de fermentation pour la production d’un microbiote intestinal porcin Thèses et mémoires dirigés / 2022 - 2022
Graduate : Bellerose, Mathieu
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Détermination de la contamination microbiologique des litières de fumier recyclé en filière de production bovine en fonction des pratiques de productions et de gestion en élevage. Thèses et mémoires dirigés / 2021 - 2021
Graduate : Beauchemin, Jessika
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Utilisation de la vaccinologie réverse pour l’identification de protéines candidates vaccinales chez Clostridium perfringens causant l’entérite nécrotique aviaire Thèses et mémoires dirigés / 2020 - 2020
Graduate : Meniaï, Ilhem
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude de la distribution de campylobacter à différentes étapes de la transformation primaire de la volaille dans des abattoirs du Québec Thèses et mémoires dirigés / 2020 - 2020
Graduate : Quessy, Alexandre
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Modulation de l’action antimicrobienne in vitro d’extraits de plantes en condition de compétition par un dérivé de microbiote d’origine fécale porcine Thèses et mémoires dirigés / 2019 - 2019
Graduate : Langlais, Mélodie
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Research projects Expand all Collapse all

Defining the impact of nutrients on the chicken microbiota and its coloniation by Campylobacter jejuni. Projet de recherche au Canada / 2024 - 2030

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

Defining the impact of nutrients on the chicken microbiota and its coloniation by Campylobacter jejuni. Projet de recherche au Canada / 2024 - 2030

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(DGECR) Tremplin vers la découverte

Appui au Centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2029

Lead researcher : Mariela Segura
Co-researchers : Martine Boulianne , John Morris Fairbrother , Marcelo Gottschalk , France Daigle , Jean-Pierre Vaillancourt , Carl A. Gagnon , Francis Beaudry , Marie Archambault , Nancy Beauregard , Julie Arsenault , Younès Chorfi , Marie-Odile Benoit-Biancamano , Levon Abrahamyan , Christopher Fernandez Prada , Marcio Costa , Marie-Ève Lambert , Neda Barjesteh , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma , Imourana Alassane-Kpembi , Nahuel Fittipaldi , François Malouin , Sebastien Faucher , Charles Dozois , Xin Zhao , Denis Archambault , René Roy , Caroline Duchaine , Steve Charette , Mircea A. Mateescu , Steve Bourgault , Jennifer Ronholm , George Saji , Martin Olivier , Michel Frenette , Jean-Philippe Rocheleau , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Sébastien Fournel , Maurice Doyon , Shiv O Prasher , Paul Thomassin , Linda Saucier , Vincent Burrus , Jonathan Perreault , Marie-Joelle Brassard , Jamie Dallaire , Charles Gauthier , Antony Vincent
Funding sources: Producteurs d'œufs d'incubation du Qc
Grant programs:

Centre de Recherche en Infectiologie Porcine et Avicole (CRIPA) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2029

Lead researcher : Mariela Segura
Co-researchers : Martine Boulianne , John Morris Fairbrother , Marcelo Gottschalk , France Daigle , Jean-Pierre Vaillancourt , Carl A. Gagnon , Francis Beaudry , Marie Archambault , Nancy Beauregard , Julie Arsenault , Younès Chorfi , Marie-Odile Benoit-Biancamano , Levon Abrahamyan , Christopher Fernandez Prada , Marcio Costa , Marie-Ève Lambert , Neda Barjesteh , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma , Imourana Alassane-Kpembi , Nahuel Fittipaldi , François Meurens , Maud de Lagarde , François Malouin , Sebastien Faucher , Charles Dozois , Xin Zhao , Denis Archambault , René Roy , Caroline Duchaine , Steve Charette , Mircea A. Mateescu , Steve Bourgault , Jennifer Ronholm , George Saji , Martin Olivier , Michel Frenette , Jean-Philippe Rocheleau , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Sébastien Fournel , Maurice Doyon , Shiv O Prasher , Paul Thomassin , Linda Saucier , Vincent Burrus , Jonathan Perreault , Marie-Joelle Brassard , Jamie Dallaire , Charles Gauthier , Antony Vincent , Alexander Bekele-Yitbarek , Paul George
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

Appui au Centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2029

Lead researcher : Mariela Segura
Co-researchers : Martine Boulianne , John Morris Fairbrother , Marcelo Gottschalk , France Daigle , Jean-Pierre Vaillancourt , Carl A. Gagnon , Francis Beaudry , Marie Archambault , Nancy Beauregard , Julie Arsenault , Younès Chorfi , Marie-Odile Benoit-Biancamano , Levon Abrahamyan , Christopher Fernandez Prada , Marcio Costa , Marie-Ève Lambert , Neda Barjesteh , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma , Imourana Alassane-Kpembi , Nahuel Fittipaldi , François Malouin , Sebastien Faucher , Charles Dozois , Xin Zhao , Denis Archambault , René Roy , Caroline Duchaine , Steve Charette , Mircea A. Mateescu , Steve Bourgault , Jennifer Ronholm , George Saji , Martin Olivier , Michel Frenette , Jean-Philippe Rocheleau , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Sébastien Fournel , Maurice Doyon , Shiv O Prasher , Paul Thomassin , Linda Saucier , Vincent Burrus , Jonathan Perreault , Marie-Joelle Brassard , Jamie Dallaire , Charles Gauthier , Antony Vincent
Funding sources: PORCIMA
Grant programs:

Appui au Centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2029

Lead researcher : Mariela Segura
Co-researchers : Martine Boulianne , John Morris Fairbrother , Marcelo Gottschalk , France Daigle , Jean-Pierre Vaillancourt , Carl A. Gagnon , Francis Beaudry , Marie Archambault , Nancy Beauregard , Julie Arsenault , Younès Chorfi , Marie-Odile Benoit-Biancamano , Levon Abrahamyan , Christopher Fernandez Prada , Marcio Costa , Marie-Ève Lambert , Neda Barjesteh , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma , Imourana Alassane-Kpembi , Nahuel Fittipaldi , François Meurens , Maud de Lagarde , François Malouin , Sebastien Faucher , Charles Dozois , Xin Zhao , Denis Archambault , René Roy , Caroline Duchaine , Steve Charette , Mircea A. Mateescu , Steve Bourgault , Jennifer Ronholm , George Saji , Martin Olivier , Michel Frenette , Jean-Philippe Rocheleau , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Sébastien Fournel , Maurice Doyon , Shiv O Prasher , Paul Thomassin , Linda Saucier , Vincent Burrus , Jonathan Perreault , Marie-Joelle Brassard , Jamie Dallaire , Charles Gauthier , Antony Vincent , Paul George , Laurent Chatel-Chaix , Marie-Hélène Deschamps
Funding sources: Fédération des producteurs d'oeufs du Québec
Grant programs:

Appui au Centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2029

Lead researcher : Mariela Segura
Co-researchers : Martine Boulianne , John Morris Fairbrother , Marcelo Gottschalk , France Daigle , Jean-Pierre Vaillancourt , Carl A. Gagnon , Francis Beaudry , Marie Archambault , Nancy Beauregard , Julie Arsenault , Younès Chorfi , Marie-Odile Benoit-Biancamano , Levon Abrahamyan , Christopher Fernandez Prada , Marcio Costa , Marie-Ève Lambert , Neda Barjesteh , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma , Imourana Alassane-Kpembi , Nahuel Fittipaldi , François Malouin , Sebastien Faucher , Charles Dozois , Xin Zhao , Denis Archambault , René Roy , Caroline Duchaine , Steve Charette , Mircea A. Mateescu , Steve Bourgault , Jennifer Ronholm , George Saji , Martin Olivier , Michel Frenette , Jean-Philippe Rocheleau , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Sébastien Fournel , Maurice Doyon , Shiv O Prasher , Paul Thomassin , Linda Saucier , Vincent Burrus , Jonathan Perreault , Marie-Joelle Brassard , Jamie Dallaire , Charles Gauthier , Antony Vincent
Funding sources: EVAH
Grant programs:

Activités de transfert_Dynamique de diffusion des gènes de résistance et de virulence d'Escherichia coli dans les populations porcine et bovine. Projet de recherche au Canada / 2024 - 2028

Lead researcher : Maud de Lagarde
Co-researchers : John Morris Fairbrother , Sébastien Buczinski , Julie Arsenault , Alexandre Thibodeau , Pablo Valdes Donoso , Marie-Lou Gauthier , Marcelo Almaida
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs: PVXXXXXX-Innovation bioalimentaire 2023-2028 - Volet 2: Recherche appliquée, développement expérimental et adaptation technologique

Contrôle de la colibacillose en filière ponte au Québec : Optimisation du schéma posologique de l'oxytétracycline et utilisation des approches alternatives Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Lead researcher : Mohamed Rhouma
Co-researchers : Francis Beaudry , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau
Funding sources: Larvatria
Grant programs:

Contrôle de la colibacillose en filière ponte au Québec : Optimisation du schéma posologique de l'oxytétracycline et utilisation des approches alternatives Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Lead researcher : Mohamed Rhouma
Co-researchers : Francis Beaudry , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau
Funding sources: Fédération des producteurs d'oeufs du Québec , Ministère de l’Enseignement supérieur
Grant programs: ,

Contrôle de la colibacillose en filière ponte au Québec : Optimisation du schéma posologique de l'oxytétracycline et utilisation des approches alternatives Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Lead researcher : Mohamed Rhouma
Co-researchers : Francis Beaudry , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau

Contrôle de la colibacillose en filière ponte au Québec : Optimisation du schéma posologique de l'oxytétracycline et utilisation des approches alternatives Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Funding sources: Phytosynthèse inc. (France)
Grant programs:

Optimization of oxytetracycline dosing regimen and characterization of the effect of new alternative approaches in the treatment of colibacillosis in laying hens in Canada Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Lead researcher : Mohamed Rhouma
Co-researchers : Francis Beaudry , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions Alliance - Option 1

Contrôle de la colibacillose en filière ponte au Québec : Optimisation du schéma posologique de l'oxytétracycline et utilisation des approches alternatives Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Lead researcher : Mohamed Rhouma
Co-researchers : Francis Beaudry , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau
Funding sources: CRIBIQ/Consortium de recherche et innovations en bioprocédés industriels au Québec
Grant programs:

Projet Recherche_Dynamique de diffusion des gènes de résistance et de virulence d'Escherichia coli dans les populations porcine et bovine. Projet de recherche au Canada / 2024 - 2027

Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs: PVXXXXXX-Innovation bioalimentaire 2023-2028 - Volet 2: Recherche appliquée, développement expérimental et adaptation technologique

Utilisation des dérivés d’insectes et des phytodérivés pour améliorer la santé du porcelet et combattre les pathogènes alimentaires Projet de recherche au Canada / 2023 - 2026

Funding sources: Larvatria
Grant programs:

Utilisation des dérivés d’insectes et des phytodérivés pour améliorer la santé du porcelet et combattre les pathogènes alimentaires Projet de recherche au Canada / 2023 - 2026

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Co-researchers : Mohamed Rhouma , Guillaume St-Jean , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Marie-Hélène Deschamps
Funding sources: Phytosynthèse inc. (France)
Grant programs:

Utilisation des dérivés d’insectes et des phytodérivés pour améliorer la santé du porcelet et combattre les pathogènes alimentaires Projet de recherche au Canada / 2023 - 2026

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Co-researchers : Mohamed Rhouma , Guillaume St-Jean , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Marie-Hélène Deschamps
Funding sources: PORCIMA
Grant programs:

Utilisation des dérivés d’insectes et des phytodérivés pour améliorer la santé du porcelet et combattre les pathogènes alimentaires. Projet de recherche au Canada / 2023 - 2026

Funding sources: CRIBIQ/Consortium de recherche et innovations en bioprocédés industriels au Québec
Grant programs:

Impact of insects by-products and phytogenics on the piglet's intestinal health. Projet de recherche au Canada / 2023 - 2026

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Co-researchers : Mohamed Rhouma , Guillaume St-Jean , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Marie-Hélène Deschamps
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions Alliance - Option 1

Plan de transfert de connaissances_Analyse du résistome des bovins laitiers au Québec avant et après la restriction de l’utilisation des antibiotiques de catégorie 1 Projet de recherche au Canada / 2022 - 2026

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:

Nouvelles Initiatives du CRIPA en partenariat avec IRSST Projet de recherche au Canada / 2022 - 2026

Lead researcher : Mariela Segura
Co-researchers : Martine Boulianne , John Morris Fairbrother , Marcelo Gottschalk , France Daigle , Jean-Pierre Vaillancourt , Carl A. Gagnon , Francis Beaudry , Marie Archambault , Nancy Beauregard , Julie Arsenault , Younès Chorfi , Marie-Odile Benoit-Biancamano , Levon Abrahamyan , Christopher Fernandez Prada , Marcio Costa , Marie-Ève Lambert , Neda Barjesteh , Marie-Lou Gaucher , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma , Imourana Alassane-Kpembi , Nahuel Fittipaldi , François Meurens , Maud de Lagarde , François Malouin , Sebastien Faucher , Charles Dozois , Xin Zhao , Denis Archambault , René Roy , Caroline Duchaine , Steve Charette , Mircea A. Mateescu , Steve Bourgault , Jennifer Ronholm , George Saji , Martin Olivier , Michel Frenette , Jean-Philippe Rocheleau , Marie-Pierre Létourneau-Montminy , Sébastien Fournel , Maurice Doyon , Shiv O Prasher , Paul Thomassin , Linda Saucier , Vincent Burrus , Jonathan Perreault , Marie-Joelle Brassard , Jamie Dallaire , Charles Gauthier , Antony Vincent , Paul George , Laurent Chatel-Chaix , Marie-Hélène Deschamps
Funding sources: IRSST/Institut de recherche Robert-Sauvé en santé et en sécurité du travail
Grant programs: PVXXXXXX-Programme de recherche

Optimisation de la salubrité des produits de viande de poulet par un meilleur contrôle de Salmonella et de Clostridium perfringens entérotoxinogène en production avicole Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Lead researcher : Marie-Lou Gaucher
Co-researchers : Sylvain Quessy , Francis Beaudry , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma
Funding sources: CQTV/Conseil qc transformation volaille
Grant programs:

Optimisation de la salubrité des produits de viande de poulet par un meilleur contrôle de Salmonella et de Clostridium perfringens entérotoxinogène en production avicole Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Lead researcher : Marie-Lou Gaucher
Co-researchers : Sylvain Quessy , Francis Beaudry , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma
Funding sources: Les Couvoiriers du Québec inc.
Grant programs:

Optimisation de la salubrité des produits de viande de poulet par un meilleur contrôle de Salmonella et de Clostridium perfringens entérotoxinogène en production avicole Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Lead researcher : Marie-Lou Gaucher
Co-researchers : Sylvain Quessy , Francis Beaudry , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma
Funding sources: Producteurs d'œufs d'incubation du Qc
Grant programs:

Optimisation de la salubrité des produits de viande de poulet par un meilleur contrôle de Salmonella et de Clostridium perfringens entérotoxinogène en production avicole Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Lead researcher : Marie-Lou Gaucher
Co-researchers : Sylvain Quessy , Francis Beaudry , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma
Funding sources: AQINAC/Ass qc nutrition animale &céréale
Grant programs:

Optimisation de la salubrité des produits de viande de poulet par un meilleur contrôle de Salmonella et de Clostridium perfringens entérotoxinogène en production avicole Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Lead researcher : Marie-Lou Gaucher
Co-researchers : Sylvain Quessy , Francis Beaudry , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma
Funding sources: Les Éleveurs de volailles du Québec
Grant programs:

Optimisation de la salubrité des produits de viande de poulet par un meilleur contrôle de Salmonella et de Clostridium perfringens entérotoxinogène en production avicole Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Lead researcher : Marie-Lou Gaucher
Co-researchers : Sylvain Quessy , Francis Beaudry , Alexandre Thibodeau , Mohamed Rhouma
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:

Appui au Centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Funding sources: Municipalité régionale de comté des Maskoutains
Grant programs:

Plan de financement_Analyse du résistome des bovins laitiers au Québec avant et après la restriction de l’utilisation des antibiotiques de catégorie 1 Projet de recherche au Canada / 2022 - 2025

Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:

Plan de financement_Validation du traitement intra-utérin de propolis/miel lors d’endométrites post-partum chez la vache laitière des troupeaux biologiques Projet de recherche au Canada / 2021 - 2025

Lead researcher : Réjean Lefebvre
Co-researchers : David Francoz , Alexandre Thibodeau
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:

Plan de transfert de connaissances_Validation du traitement intra-utérin de propolis/miel lors d’endométrites post-partum chez la vache laitière des troupeaux biologiques Projet de recherche au Canada / 2021 - 2025

Lead researcher : Réjean Lefebvre
Co-researchers : David Francoz , Alexandre Thibodeau
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:

Plan de transfert de connaissances_Caractérisation en bioréacteur de la dose efficace d'un nouveau probiotique destiné au porc pour limiter la colonisation par Salmonella et la dysbiose intestinale Projet de recherche au Canada / 2020 - 2024

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Co-researchers : Sylvain Quessy , Martin Fillion , Yves Arcand
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:

Towards a new feeding approach of neonatal and weanling piglet for optimizing nutritional status, immunity and microbiota and minimizing the use of antibiotics Projet de recherche au Canada / 2021 - 2023

Funding sources: PhenoSwitch Bioscience
Grant programs:

Plan de financement_Caractérisation en bioréacteur de la dose efficace d'un nouveau probiotique destiné au porc pour limiter la colonisation par Salmonella et la dysbiose intestinale Projet de recherche au Canada / 2020 - 2023

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Co-researchers : Sylvain Quessy , Martin Fillion , Yves Arcand

Towards a new feeding approach of neonatal and weanling piglet for optimizing nutritional status, immunity and microbiota and minimizing the use of antibiotics Projet de recherche au Canada / 2020 - 2023

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Funding sources: Swine Innovation Porc
Grant programs:

Caractérisation en bioréacteur de la dose efficace d'un nouveau probiotique destiné au porc pour limiter la colonisation par Salmonella et la dysbiose intestinale Projet de recherche au Canada / 2020 - 2023

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Co-researchers : Sylvain Quessy , Martin Fillion , Yves Arcand
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation , Nuvac Eco-Science inc.
Grant programs: ,

Caractérisation en bioréacteur de la dose efficace d'un nouveau probiotique destiné au porc pour limiter la colonisation par Salmonella et la dysbiose intestinale Projet de recherche au Canada / 2021 - 2022

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Funding sources: MITACS Inc.
Grant programs: PVXXXXXX-Stage Accélération Québec - MITACS

Publications Expand all Collapse all

Articles scientifiques

Beauchemin, J.; Fréchette, A.; Thériault, W.; Dufour, S.; Fravalo, P.; Thibodeau, A. (2022, janvier). Comparison of microbiota of recycled manure solids and straw bedding used in dairy farms in eastern Canada. Journal of Dairy Science, 105, 389 - 408.DOI : 10.3168/jds.2021-20523

Meniaï, I.; Thibodeau, A.; Quessy, S.; Parreira, V.; Fravalo, P.; Beauchamp, G.; Gaucher, M. (2021, décembre). Putative antigenic proteins identified by comparative and subtractive reverse vaccinology in necrotic enteritis-causing Clostridium perfringens isolated from broiler chickens. BMC Genomics, 22.DOI : 10.1186/s12864-021-08216-7

Shedleur-Bourguignon, F.; Thériault, W.; Longpré, J.; Thibodeau, A.; Fravalo, P. (2021, octobre). Use of an Ecosystem-Based Approach to Shed Light on the Heterogeneity of the Contamination Pattern of Listeria monocytogenes on Conveyor Belt Surfaces in a Swine Slaughterhouse in the Province of Quebec, Canada. Pathogens, 10, 1368 - 1368.DOI : 10.3390/pathogens10111368

M., Rhouma; *Braley, C.; Thériault, W.; Thibodeau, A.; Quessy, S.; Fravalo, P. (2021). Evolution of Pig Fecal Microbiota Composition and Diversity in Response to Enterotoxigenic Escherichia coli Infection and Colistin Treatment in weaned Piglets. Microorganisms.DOI : 10.3390/microorganisms9071459

*Lariviere-Gauthier, G; A. Thibodeau, A; Yergeau, E; Fravalo, P. (2021). Sows affect their piglets' faecal microbiota until fattening but not their Salmonella enterica shedding status. Letters in Applied Microbiology, 72(2), 113-120.

*Boubendir, S; Arsenault, J; Quessy, S; Thibodeau, A; Fravalo, P; Theriault, W; Fournaise, S; Gaucher, ML. (2021). Salmonella Contaminationof Broiler Chicken Carcasses at Critical Steps of the Slaughter Process and in the Environment of Two Slaughter Plants: Prevalence, Genetic Profiles, and Association with the Final Carcass Status. Journal of Food Protection, 84(2), 321-332.

*Turcotte, C; Thibodeau, A; Quessy, S; Topp, E; Beauchamp, G; Fravalo, P; Archambault, M; Gaucher, ML. (2020). Impacts of Short-Term Antibiotic Withdrawal and Long-Term Judicious Antibiotic Use on Resistance Gene Abundance and Cecal Microbiota Composition on Commercial Broiler Chicken Farms in Quebec. Frontiers in Veterinary Science.

*Trudeau, S; Thibodeau, A; Côté, JC; Gaucher, ML; Fravalo, P. (2020). Contribution of the Broiler Breeders' Fecal Microbiota to the Establishment of the Eggshell Microbiota. Frontiers in microbiology, 11, 666.

*Rabhi, N; Thibodeau, A; Cote, JC; Devillers, N; Laplante, B; Fravalo, P; Lariviere-Gauthier, G; Theriault, W; Faucitano, L; Beauchamp, G; Quessy, S. (2020). Association Between Tail-Biting and Intestinal Microbiota Composition in Pigs. Frontiers in Veterinary Science.

*Langlais, M; Thibodeau, A; Fravalo, P. (2019). A metagenomic analysis of the pre-enrichment step for the isolation of Salmonella spp. from pig feces. Journal of microbiological methods, 157, 43-46.

*Soumaila, Garba A; Thibodeau, A; Perron, A; Laurent-Lewandowski, S; Letellier, A; Fravalo, P. (2019). In vitro efficacy of potentiated egg yolk powder against Campylobacter jejuni does not correlate with in vivo efficacy. PloS One, 14(3), e0212946.

*Larivière-Gauthier, G; Thibodeau, A; Letellier, A; Yergeau, É; Fravalo, P. (2019). Salmonella shedding status of the sow affects the microbiota of their piglets at weaning. Journal of applied microbiology, 126(2), 411-423.

*Lafrance-Girard, C; Arsenault, J; Thibodeau, A; Opsteegh, M; Quessy, S. (2018). Toxoplasma gondii in Retail Beef, Lamb, and Pork in Canada: Prevalence, Quantification, and Risk Factors from a Public Health Perspective. Foodborne Pathogens and Disease, 15(12).DOI : 10.1089/fpd.2018.2479

*Kagambèga, A; Thibodeau, A; Trinetta, V; Soro, DK; Sama, FN; Bako, É; Bouda, CS; Wereme, N'Diaye A; Fravalo, P; Barro, N. (2018). Salmonella spp. and Campylobacter spp. in poultry feces and carcasses in Ouagadougou, Burkina Faso. Food science & nutrition, 6(6), 1601-1606.

*Gaucher, ML; Thibodeau, A; Fravalo, P; Archambault, M; Arsenault, J; Fournaise, S; Letellier, A; Quessy, S. (2018). Broiler chicken carcasses and their associated abattoirs as a source of enterotoxigenic Clostridium perfringens: Prevalence and critical steps for contamination. AIMS microbiology, 4(3), 439-454.

Thibodeau A., P. Fravalo, A. Perron, S. Laurent-Lewandowski, A. Letellier. Production and characterization of anti-Campylobacter jejuni IgY derived from egg yolks. Acta Vet Scand. 2017 Dec 6;59(1):80 doi: 10.1186/s 13028-017-0346-4.

Larivière-Gauthier G., A. Thibodeau, A. Letellier, É. Yergeau, P. Fravalo. Reduction of Salmonella Shedding by sows during gestation in relation to its fecal microbiome. Front Microbiol. 2017 Nov 10;8:2219. Doi: 10.3389/fmicb.2017.02219

Trigui H, K. Lee , A. Thibodeau, S. Lévesque, N. Mendis, P. Fravalo, A. Letellier, S.P. Faucher. Phenotypic and Transcriptomic Responses of Campylobacter jejuni suspended in an Artificial Freshwater medium. Front Microbiol. 2017 Sep 20;8:1781. Doi : 10.3389/fmicb.2017.01781.

Thibodeau A., A. Letellier, E. Yergeau, G. Larivière-Gauthier, P. Fravalo. Lack of evidence that Selenium-yeast improves chicken health and modulates the caecal microbiota in the context of colonisation by Campylobacter jejuni. Frontiers in microbiology. 2017 Mar 17;8:451. Doi: 10.3389/fmicb.2017.00451

Trigui H., A. Thibodeau, P. Fravalo, A. Letellier, S. Faucher. Survival in water of Campylobacterjejuni strains isolated from the slaughterhouse. Springerplus. 2015 Dec 22; 4 : 799.

Thibodeau A., P. Fravalo, É. Yergeau, J. Arsenault, L. Lahaye, A. Letellier. (2015). Chicken caecal microbiome modifications induced by Campylobacter jejuni colonization and by a non-antibiotic feed additive. PLoS One. Jul 10;10(7) : e0131978.

Thibodeau A., P. Fravalo, E.N. Taboada, S. Laurent-Lewandowski, É. Guévremont, S. Quessy, A. Letellier. Extensive characterization of Campylobacter jejuni chicken isolates to uncover genes involved in the ability to compete for gut colonization. BMC Microbiology. 10(15) : 97. Highly Accessed.

Thibodeau A., P. Fravalo, R. Gauthier, É. Guévremont, N. Bergeron, S. Laurent-Lewandowski, S. Quessy, M. Boulianne, A. Letellier. Modification of Campylobacter jejuni broiler colonization by a feed additive composed of encapsulated organic acids and essential oils. Journal of Agricultural Science and Technology A. 4(10) : 853-864.

Thibodeau A., P. Fravalo, P. Garneau, l. Masson, S. Laurent-Lewandowski, É. Guévremont, S. Quessy, J. Harel, A. Letellier. Distribution of colonization and antimicrobial resistance genes in Campylobacter jejuni isolated from chicken. Foodborne Pathogens and Disease. 10(4) : 382-391.

Thibodeau A., P. Fravalo, S. Laurent-Lewandowski, É. Guévremont, S. Quessy, A. Letellier. Presence and Characterization of Campylobacter jejuni from Québec organic chickens productions. Canadian Journal of Veterinary Research. 75(4) : 298-307.

Thibodeau A., S. Quessy, É. Guévremont, A. Houde, E. Topp, S. Diarra, A. Letellier. Antibiotic resistance in Escherichia coli and Enterococcus spp. isolates from commercial broiler chickens receiving growth-promoting doses of bacitracin or virginiamycin. Canadian Journal of Veterinary Research. 72(2) : 129-136.

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Conférencier invité

  • Thibodeau A., P. Fravalo, E.N. Taboada, A. Letellier. Campylobacter jejuni and chicken colonisation: different strains, different abilities. Clinical Microbiology, octobre 2016. Rome, Italy.
  • Thibodeau A. Salmonella and Campylobacter, farm control strategies in poultry production. Jefo poultry tour (2014), Saint-Hyacinthe, Canada
  • Thibodeau A. Contrôle de Salmonella chez le porc et de Campylobacter chez la volaille : impact de la texture/granulométrie de l’aliment et de l’ajout d’additifs naturels. Intégrer des ingrédients novateurs en alimentation porcine et avicole (2014), Drummondville, Canada.
  • Thibodeau A. Où en sommes-nous dans le contrôle de Campylobacter jejuni chez la volaille. Journée de l’AVIA (2013), Saint-Hyacinthe, CanadaThibodeau A. Contrôle de Campylobacter jejuni : de la ferme à la table. Fondation Initia (2013), Saint-Hyacinthe, Canada
  • Thibodeau A. Reducing Campylobacter: an integrated approach. Canadian Meat Council Technical Symposium on Pathogen Reduction (2011), Toronto, CanadaThibodeau A. Understanding Campylobacter. Canadian Poultry and Egg Processor Council 2011 Convention, St-John's, Canada

Présentations orales

  • Thibodeau A., P. Fravalo, É. Yergeau, J. Arsenault, L. Lahaye, A. Letellier. Modification of the chicken cecal microbiome by Campylobacter jejuni colonization and by a feed additive. Symposium on Gut Health in Production of Food Animals 2014, St.Louis, États-Unis.
  • Thibodeau A., P. Fravalo, L. Lahaye, M. Boulianne, J. Arsenault, É. Yergeau, A. Letellier. Microbiote cæcal du poulet : effet de la présence de Campylobacter jejuni et de stratégies alimentaires de contrôle. 1er Symposium annuel du CRIPA (2014), Saint-Hyacinthe, Canada.Thibodeau A., S. Laurent-Lewandowski, É. Guévremont, S. Quessy, A. Letellier. Lack of correlation between Campylobacter jejuni in vitro phenotypic properties in field isolates. 5e symposium du CRIP (2012), Saint-Hyacinthe, Canada. Award : best conference, 2nd place, 500 $ (CA)
  • Thibodeau A., J. Harel, P. Garneau, É. Guévremont, S. Quessy, S. Laurent-Lewandowski, P. Fravalo P, L. Masson, A. Letellier. Microarray characterization of Campylobacter jejuni genes involved in colonization and antimicrobial resistance of broiler chickens.4ième symposium du CRIP (2011), Saint-Hyacinthe, CanadaThibodeau A., J. Harel, P. Garneau, É. Guévremont, S. Quessy, S. Laurent-Lewandowski, P. Fravalo P, L. Masson, A. Letellier. Développement d’une puce à ADN pour l’étude de gènes associés à la colonisation du poulet par Campylobacter jejuni. 5e Colloque International Francophone de Microbiologie Animale (2011), Marrakech, Maroc
  • Thibodeau A., A. Fugère, É. Guévremont, S. Quessy, S. Laurent-Lewandowski, P. Fravalo P, A. Letellier. Caractérisation d’isolats de Campylobacter jejuni provenant de poulets du Québec. ACFAS (2010), Québec, Canada
  • Thibodeau A., M. Boulianne, S. Quessy, A. Letellier. Impact of antimicrobial agents use in poultry and investigation of the relationship between virulence and antimicrobial resistance in Salmonella and Campylobacter jejuni isolates. Poultry Industrial Council Research Day (2009), Guelph, Canada
  • Bélanger M., P. Fravalo, R. Gauthier, A. Letellier, G. Roch, J. M. Repérant, A. Thibodeau, M. Boulianne. Mise au point d’un modèle d’infection expérimentale d’entérite nécrotique chez le poulet de chair. 4e Colloque international francophone de microbiologie animale (2008), Saint-Hyacinthe, Canada
  • Tran Thi Quynh L., M. Boulianne, A. Letellier, A. Desrosiers, A. Thibodeau, S. Quessy. Étude de la réponse immunitaire de la poule pondeuse suite à la vaccination avec des bactérines de Salmonella Enteritidis. 4e Colloque international francophone de microbiologie animale (2008), Saint-Hyacinthe, Canada
  • Thibodeau A., S. Quessy, É. Guévremont, A. Houde, E. Topp, S. Diarra, A. Letellier. Utilisation de bacitracine et de virginiamycine comme promoteurs de croissance chez les poulets de gril : Effet sur la performance et l’antibiorésistance. 4e Colloque international francophone de microbiologie animale (2008), Saint-Hyacinthe, Canada

Présentations par affiche (posters)

  • Thibodeau A., P. Fravalo, A. Letellier. Effect of organic selenium on chicken intestinal health and C. jejuni carriage. Symposium on Gut Health in Production of Food Animals 2015, Kansas City, États-Unis.
  • Soumaila Garba A., A. Thibodeau, A. Perron, S. Laurent-Lewandowski, A. Letellier, P. Fravalo. Contrôle de Campylobacter jejuni chez le poulet à griller : utilisation de poudre de jaunes d’œufs potentialisés.2ième Symposium du CRIPA, Saint-Hyacinthe, Canada, 2015-05-21
  • Soumaila Garba A, A. Perron, A. Thibodeau, S. Laurent-Lewandowski, A. Letellier, P. Fravalo. Contrôle de Campylobacter jejuni chez le poulet à griller : utilisation de poudre de jaune d’oeuf. 1er Symposium du CRIPA, Saint-Hyacinthe, Canada, 2014-06-03Thibodeau A., P. Fravalo, S. Laurent-Lewandowski, N. Bergeron, É. Guèvremont, S. Quessy, M. Boulianne, L. Lahaye, A. Letellier. Following Campylobacter jejuni colonization with the use of the high resolution melt analysis of the flaA gene. 6e symposium annuel du CRIP, Saint-Hyacinthe, Canada, 2013-05-07
  • Thibodeau A., P. Fravalo, P. Garneau, L. Masson, S. Laurent-Lewandowski, S. Quessy, É. Guèvremont, J. Harel, A. Letellier. Les caractérisations phénotypique et génotypique de souches de Campylobacter jejuni suggèrent que la résistance à l’arsenic ainsi que le système de restriction modification de type I pourraient être impliqués dans la colonisation cæcale du poulet. Journée de la recherche de la Faculté de médecine vétérinaire, Saint-Hyacinthe, Canada, 2012-10-14
  • Thibodeau A., P. Fravalo, S. Laurent-Lewandowski, N. Bergeron, É. Guèvremont, S. Quessy, M. Boulianne, R. Gauthier, A. Letellier. An encapsulated blend of essential oils and organic acids used as feed additive lowers broiler chicken Campylobacter carcass contamination without any beneficial effect in the caecum. Canadian Campylobacter Workshop, Ottawa, Canada, 2012-10-24
  • Thibodeau A., J. Harel, P. Garneau, É. Guévremont, S. Quessy, S. Laurent-Lewandowski, P. Fravalo P, L. Masson, A. Letellier. Microarray characterization of Campylobacter jejuni genes involved in colonization and antimicrobial resistance of broiler chickens. CHRO Vancouver 2011, Vancouver, Canada, 2011-08-28Thibodeau A., J. Harel, P. Garneau, É. Guévremont, S. Quessy, S. Laurent-Lewandowski, P. Fravalo P, L. Masson, A. Letellier. Étude d’isolats de Campylobacter jejuni isolés du poulet à griller. Journée de la recherche de la Faculté de médecine vétérinaire, Saint-Hyacinthe, Canada, 2011-03-10
  • Thibodeau A., É. Guévremont, S. Quessy, S. Laurent-Lewandowski, P. Fravalo, A. Letellier. Caractérisation d’isolats de Campylobacter jejuni provenant de poulets biologiques du Québec. 3e Symposium annuel du CRIP (2010), Saint-Hyacinthe, Canada, 2010-05-10Thibodeau A., É. Guévremont, S. Quessy, A. Letellier. Étude de l’antibiorésistance chez Campylobacter jejuni. Journée de la recherche de la Faculté de médecine vétérinaire (2009), Saint — Hyacinthe, Canada, 2009-02-26
  • Thibodeau A., S. Quessy, É. Guévremont, A. Houde, E. Topp, S. Diarra, A. Letellier. Antibiotic Resistance in Escherichia coli and Enterococcus spp. Obtained from Commercial Broiler Chickens Receiving Growth-Promoting Doses of Bacitracin or Virginiamycin. Americain Society for Microbiology, 107th General Meeting, Toronto, Canada, 2007-05-21

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