Ma formation en pathologie aviaire est à la base de mon intérêt pour la compréhension des maladies, de leur transmision et des interactions hôte-pathogène. Mon parcours professionnel est enrichi par une solide expérience des pathogènes bactériens chez la volaille et ces connaissances ont permis le développement de plusieurs modèles d’infection expérimentale au Centre de recherche avicole. Mes travaux de recherche visent à réduire l’utilisation des antibiotiques en développant de nouvelles stratégies et outils pour le contrôle de maladies bactériennes, telles que l’entérite nécrotique (Clostridium perfringens), les infections à Enterococcus cecorum et à Escherichia coli. Un autre volet majeur de mes travaux s’intéresse à l’effet des systèmes d’élevage alternatifs sur la santé et le bien-être des poules pondeuses, toujours avec l’objectif d’offrir des solutions pratiques, durables et adaptées aux défis de l’industrie avicole.

Les maladies infectieuses animales et tout particulièrement les maladies virales porcines telles que le syndrome reproducteur et respiratoire porcin, les maladies associées au circovirus porcin et la grippe porcine. Certains projets de recherche du Dr Gagnon ciblent: 1) les mécanismes antiviraux et 2) la pathogenèse des infections animales mixtes (bactéries-virus, virus-virus) et donc qui étudient les interactions pathogènes-pathogènes. En tant que directeur scientifique du seul laboratoire universitaire québécois de diagnostic des maladies infectieuses virales animales, le Dr Gagnon réalise divers projets de caractérisation de nouveaux virus et de virus réémergents chez tous les animaux (domestiques, fermes, exotiques, faune).

• Maladies et santé des oiseaux de production (notamment le poulet et la dinde).
• Épidémiologie des zoonoses aviaires et santé publique
• Rôle et impact de l’agroenvironnement dans l’épidémiologie des maladies zoonotiques
• Structures et méthodes de la surveillance
• Mise au point d’outils d’aide à la décision en santé publique