• Recherche en détection et typage des pathogènes d’intérêt en hygiène alimentaire
• Caractérisation des écosystèmes microbiens des surfaces en agro-alimentaire
• Microbiologie des procédés industriels agro-alimentaires
• Programmes de surveillance et de maîtrise des pathogènes alimentaires dans les filières avicoles et porcines

Ma recherche porte sur les pathogènes alimentaires, leur colonisation des animaux d’élevage et leur dissémination vers la population humaine.  Ma recherche porte autant sur la caractérisation des mécanismes propres aux pathogènes alimentaires qui leur permettent d’atteindre les humains que sur l’évolution de ces bactéries au sein des autres populations bactériennes qu’elles rencontrent;  j'observe et cherche à comprendre comment les autres bactéries peuvent influencer leur présence et surtout de quelle manière la composition de ce microbiote réagit lorsque l’on change les conditions d’élevage des animaux comme par exemple en modifiant la composition de leur nourriture en y ajoutant des huiles essentielles,  des acides organiques ou des probiotiques.

• Maladies et santé des oiseaux de production (notamment le poulet et la dinde).
• Épidémiologie des zoonoses aviaires et santé publique
• Rôle et impact de l’agroenvironnement dans l’épidémiologie des maladies zoonotiques
• Structures et méthodes de la surveillance
• Mise au point d’outils d’aide à la décision en santé publique