L’objectif à long terme de mon programme de recherche concerne l’étude des interactions hôte-virus en vue de mieux comprendre la complexité de ces interactions et de développer de nouvelles approches antivirales permettant un contrôle efficace des infections virales. Mon équipe utilise des techniques de pointe en biologie moléculaire, microscopie et virologie afin d’identifier les principaux facteurs moléculaires qui contribuent à la pathogenèse de virus animaux d’importance en santé humaine et en santé animale (p.ex. : le virus du syndrome respiratoire et reproducteur porcin (vSRRP), le virus de la diarrhée épidémique porcine (vDEP, un coronavirus), le virus de la maladie aléoutienne du vison (AMDV), le virus Zika, la dengue, SRAS, etc. De plus, je m'intéresse particulièrement au Varroa destructor, un parasite de type tique qui infeste les ruches, attaque les abeilles et leur transmet des virus.

Notre compréhension actuelle des interactions complexes entre les virus et l'animal est limitée pour un grand nombre de virus qui affectent la santé animale. Ce déficit de connaissance limite notre capacité à développer des vaccins efficaces ainsi que des stratégies antivirales. Les virus infectent les cellules animales pour assurer leur survie et leur reproduction en détournant en leur faveur les mécanismes moléculaires des cellules de l'hôte.

Les mécanismes par lesquels les virus exercent leur fonction sur l'hôte sont variables, soit qu'ils modulent la progression du cycle cellulaire, soit qu’ils stimulent ou inhibent les points de contrôle de signalisation cellulaire altérant les mécanismes de mort cellulaire programmée (apoptose) ou d'autophagie.

Plusieurs virus ont fait les manchettes depuis les 30 dernières années (p. ex.: virus Ébola, SARS, VIH, Zika, coronavirus, etc.). Quoique ces virus soient dirigés vers l'humain, il ne faut pas sous-estimer l'importance des virus véhiculés par les animaux, car certains virus peuvent être transmis aux humains (virus zoonotiques) et la compréhension de leur mécanisme d'infection permet de se préparer pour de futures épidémies.

De plus, les déplacements et le commerce international fournissent de nouvelles occasions environnementales pour l'apparition ou la réapparition de virus. Définir les interactions complexes entre les divers virus et l’hôte permettra d'améliorer notre compréhension de ces pathogènes chez l'animal et l'humain afin d'élucider de nouvelles approches mieux ciblées pour contrôler ces pathogènes et les épidémies. Mon équipe réalise divers projets de caractérisation de nouveaux virus (virus émergents) et de virus réémergents.

• Détermination de l'origine des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain dans la chaîne alimentaire et dans son environnement
• Évaluation des profils de survie ou de persistance des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain dans la chaîne alimentaire et dans son environnement
• Élaboration de stratégies de contrôle de la ferme à la table des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain
• Étudier des virus modèles ou substituts et des indicateurs viraux potentiels

Les maladies infectieuses animales et tout particulièrement les maladies virales porcines telles que le syndrome reproducteur et respiratoire porcin, les maladies associées au circovirus porcin et la grippe porcine. Certains projets de recherche du Dr Gagnon ciblent: 1) les mécanismes antiviraux et 2) la pathogenèse des infections animales mixtes (bactéries-virus, virus-virus) et donc qui étudient les interactions pathogènes-pathogènes. En tant que directeur scientifique du seul laboratoire universitaire québécois de diagnostic des maladies infectieuses virales animales, le Dr Gagnon réalise divers projets de caractérisation de nouveaux virus et de virus réémergents chez tous les animaux (domestiques, fermes, exotiques, faune).

Le Dr Meurens a commencé sa carrière scientifique avec l’étude de la recombinaison génétique chez les alphaherpèsvirus de ruminants. Ensuite lors de ses recherches menées à VIDO-InterVac (Saskatoon), l’INRAE (Tours, France) et Oniris (Nantes, France) il a infléchi sa thématique vers l’hôte porcin en considérant différents agents pathogènes porcins et humains (salmonelles, colibacille, virus influenza, vSRRP, Entamoeba histolytica, Chlamydia trachomatis…). En immunologie il affectionne les questions relatives à l’immunité des muqueuses (surtout digestive et respiratoire) et aux réponses innées, chez le porc en tant qu’espèce cible et en tant qu’espèce d’intérêt biomédical. Toutes ces recherches sont menées dans l’optique de mieux traiter nos animaux et de réduire l’usage d’antimicrobiens.

• Systèmes de surveillance de la santé: design scientifique, analyse des données, évaluation de programme de surveillance
• Analyse du risque en santé publique
• Transmission, fardeau et attribution de source des maladies infectieuses gastro-intestinales
• Risques pour la santé associés à l’eau
• Problématiques en santé publique d’origine bactérienne (salmonellose, campylobactériose, infections aux E. coli,  yersiniose, antibiorésistance), parasitaire (giardiase, cryptosporidiose, taeniasis/ neurocysticercose) et virale (rage, norovirus)