• Histopathologie
• Entomopathologie

Je participe à divers projets à titre de chercheure principale ou collaboratrice dans lesquels mon rôle est principalement centré sur mon expertise en pathologie. Je réalise des analyse histopathologiques basée sur des colorations régulières (H&E ou HPES), spéciales ou immunohistochimiques.

Le Dr Nathalie Bissonnette oriente principalement ses activités de recherche sur l'immunogénétique de l’animal, l'immunotolérance et l'immunorégulation en réponse aux nutriments, à l’environnement, et aux contacts de pathogènes.

D^re Bouchard travaille en collaboration avec plusieurs chercheur(e)s sur les déterminants du risque associés à la maladie de Lyme et autres maladies transmises par les tiques  au Canada. Son travail consiste à comprendre où se retrouvent les tiques et plus particulièrement celles infectées par des agents microbiens pathogènes pour les humains et les animaux dans le contexte des changements climatiques. Elle s’intéresse et contribue depuis 2007 à la conception et à la réalisation d’activités de recherche, de surveillance et de contrôle de foyers émergents de la maladie de Lyme et autres maladies transmises par les tiques à travers le pays. D^re Bouchard s’intéresse plus particulièrement aux facteurs socio-comportementaux et environnementaux qui influencent le risque des maladies transmises par les tiques. Son expertise spécifique en analyse statistique et spatiale soutien ce dernier intérêt. Elle manifeste avoir trouvé son terrain de jeu, soit le domaine des maladies infectieuses à l’interface homme-animal-environnement.

• Inflammation
• Oncologie
• Pathologies du système reproducteur
• Immunopathologie

• Surveillance des E.coli pathogènes chez les animaux et zoonotiques
• Influence des facteurs environnementaux sur les gènes de virulence et de résistance antimicrobienne d’E.coli dans l’écosystème intestinal de différentes espèces animales
• Identification de nouvelles adhésines fimbriaires
• Caractérisation du mécanisme d’attachement et d’effacement des E. coli d’origine animale
• Étude de la pathogénicité des E. coli
• Identification de facteurs de virulence d’E.coli causant la diarrhée post-sevrage chez le porc
• Vaccination et autres stratégies de prévention de la diarrhée post-sevrage associée à E.coli chez les animaux de production

• Recherche en détection et typage des pathogènes d’intérêt en hygiène alimentaire
• Caractérisation des écosystèmes microbiens des surfaces en agro-alimentaire
• Microbiologie des procédés industriels agro-alimentaires
• Programmes de surveillance et de maîtrise des pathogènes alimentaires dans les filières avicoles et porcines

Les maladies infectieuses animales et tout particulièrement les maladies virales porcines telles que le syndrome reproducteur et respiratoire porcin, les maladies associées au circovirus porcin et la grippe porcine. Certains projets de recherche du Dr Gagnon ciblent: 1) les mécanismes antiviraux et 2) la pathogenèse des infections animales mixtes (bactéries-virus, virus-virus) et donc qui étudient les interactions pathogènes-pathogènes. En tant que directeur scientifique du seul laboratoire universitaire québécois de diagnostic des maladies infectieuses virales animales, le Dr Gagnon réalise divers projets de caractérisation de nouveaux virus et de virus réémergents chez tous les animaux (domestiques, fermes, exotiques, faune).

Les objectifs à long terme du laboratoire de recherche sont de déveloper les connaissances sur la pathogenèse et la transmission de bactéries pathogènes animales.

Nous étudions principalement la pathogenèse d'Escherichia coli, bactérie à Gram négatif causant des maladies intestinales et extra-intestinales chez les humains et les animaux. De plus, nous comptons parmi nos sujets d'étude la bactérie à Gram positif Streptococcus suis, qui est une cause importante de septicémie et de pneumonie porcine mais aussi un agent de zoonose.

Nos intérêts principaux sont l'identification et la caractérisation des gènes impliqués dans la pathogenèse, ainsi que leurs produits exprimés pendant les différentes étapes du processus infectieux. Nous utilisons plusieurs techniques moléculaires et génétiques ainsi que des modèles d'infection.

Parce que les bactéries sont des organismes extrêmement efficaces et que leurs gènes sont généralement exprimés seulement dans les environnements où ils sont nécessaires, la caractérisation de ces gènes est une étude de choix pour développer de nouvelles alternatives aux antibiotiques. En particulier, nos études fournissent des données importantes sur (1) les facteurs de pathogenèse élaborés pendant l'infection, (2) les protéines régulatrices qui coordonnent ces événements et (3) les stimuli environnementaux qui induisent l'expression de ces gènes. Une partie de notre étude consiste donc à déterminer les rôles précis que ces diverses protéines jouent dans l'infection y compris leur interactions moléculaires.

Les sujets de recherche qui sont en cours portent sur la régulation de l'expression des gènes de fimbriae, le rôle du régulon PhoBR sur la virulence de E. coli, la formation de biofilm chez E. coli, interaction de E.coli O157:H7 avec le microbiote intestinal, la caractérisation moléculaire de souches bactériennes et des gènes de résistance aux antimicrobiens par biopuces à ADN, et aussi le développement de vaccins sous-unitaires contre E.coli et S. suis.

Mon laboratoire s'intéresse aux facteurs de virulence des bactéries pathogènes. Nous nous intéressons plus particulièrement aux polysaccharides de surface et à leur implication dans la colonisation des muqueuses de l'hôte et la formation de biofilms. Nous utilisons comme modèle d'étude la bactérie Actinobacillus pleuropneumoniae responsable de la pleuropneumonie porcine et les staphylococques à coagulase négative isolés de mammite bovine.

Isolement, identification et caractérisation des bactéries pathogènes pour les différentes espèces animales

• Oncologie comparée
• Pathologie comparée et modèles animaux de maladie humaine
• Physiopathologie du système reproducteur
• Effets des toxines environnementales sur le système reproducteur

Étude des mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans la réponse immune innée et adaptative contre les polysaccharides capsulaires ou de surface de bactéries pathogènes extracellulaires. Plus précisément, la recherche vise à définir le rôle des cellules dendritiques (CDs) dans l’orchestration de ces réponses.

Interactions nucléo-cytoplasmiques chez les embryons des mammifères. Contrôle epigénétique du développement embryonnaire. Réplication, ségrégation et patrons de transmission de l'ADN mitochondrial. Étude des mécanismes en jeu dans la maturation des ovocytes. Amélioration des techniques de clonage et transgénisme animal. Caractériser les mécanismes de reprogrammation génétique dans le clonage animal et des cellules souches pluripotentes embryonnaires et induites génétiquement.

Intérêts de recherche

• Contrôle epigénétique du développement embryonnaire;
• Héritage de l’ADN mitochondrial dans les ovules et embryons;
• Mécanismes de dérivation des cellules souches embryonnaires;
• Clonage reproductive et thérapeutiques;

Mes thématiques de recherche  ont pour objectif de mieux comprendre les mécanismes régulant le développement et la physiologie utérine chez les mammifères et la pathogenèse des maladies utérines. Je travaille actuellement à élucider les rôles de certaines voies de signalisation (dont la voie Hippo) dans la régulation physiologique de l’utérus lors du cycle œstral chez la vache. Je désire aussi déterminer le rôle de ces voies de signalisation dans le développement de pathologies utérines, dont l’endométrite bovine. En plus de la reproduction, j'ai un intérêt marqué pour la caractérisation de modèles transgéniques murins et plus récemment pour la recherche musculosquelettique.

Ma recherche porte sur les pathogènes alimentaires, leur colonisation des animaux d’élevage et leur dissémination vers la population humaine.  Ma recherche porte autant sur la caractérisation des mécanismes propres aux pathogènes alimentaires qui leur permettent d’atteindre les humains que sur l’évolution de ces bactéries au sein des autres populations bactériennes qu’elles rencontrent;  j'observe et cherche à comprendre comment les autres bactéries peuvent influencer leur présence et surtout de quelle manière la composition de ce microbiote réagit lorsque l’on change les conditions d’élevage des animaux comme par exemple en modifiant la composition de leur nourriture en y ajoutant des huiles essentielles,  des acides organiques ou des probiotiques.

• Physiologie et physiopathologie de l'ovaire: fonctions des cellules ovariennes; régulation du développement folliculaire et de l’ovulation.
• Physiologie de l'adénohypophyse: régulation de la synthèse des gonadotrophines.