L’objectif à long terme de mon programme de recherche concerne l’étude des interactions hôte-virus en vue de mieux comprendre la complexité de ces interactions et de développer de nouvelles approches antivirales permettant un contrôle efficace des infections virales. Mon équipe utilise des techniques de pointe en biologie moléculaire, microscopie et virologie afin d’identifier les principaux facteurs moléculaires qui contribuent à la pathogenèse de virus animaux d’importance en santé humaine et en santé animale (p.ex. : le virus du syndrome respiratoire et reproducteur porcin (vSRRP), le virus de la diarrhée épidémique porcine (vDEP, un coronavirus), le virus de la maladie aléoutienne du vison (AMDV), le virus Zika, la dengue, SRAS, etc. De plus, je m'intéresse particulièrement au Varroa destructor, un parasite de type tique qui infeste les ruches, attaque les abeilles et leur transmet des virus.

Notre compréhension actuelle des interactions complexes entre les virus et l'animal est limitée pour un grand nombre de virus qui affectent la santé animale. Ce déficit de connaissance limite notre capacité à développer des vaccins efficaces ainsi que des stratégies antivirales. Les virus infectent les cellules animales pour assurer leur survie et leur reproduction en détournant en leur faveur les mécanismes moléculaires des cellules de l'hôte.

Les mécanismes par lesquels les virus exercent leur fonction sur l'hôte sont variables, soit qu'ils modulent la progression du cycle cellulaire, soit qu’ils stimulent ou inhibent les points de contrôle de signalisation cellulaire altérant les mécanismes de mort cellulaire programmée (apoptose) ou d'autophagie.

Plusieurs virus ont fait les manchettes depuis les 30 dernières années (p. ex.: virus Ébola, SARS, VIH, Zika, coronavirus, etc.). Quoique ces virus soient dirigés vers l'humain, il ne faut pas sous-estimer l'importance des virus véhiculés par les animaux, car certains virus peuvent être transmis aux humains (virus zoonotiques) et la compréhension de leur mécanisme d'infection permet de se préparer pour de futures épidémies.

De plus, les déplacements et le commerce international fournissent de nouvelles occasions environnementales pour l'apparition ou la réapparition de virus. Définir les interactions complexes entre les divers virus et l’hôte permettra d'améliorer notre compréhension de ces pathogènes chez l'animal et l'humain afin d'élucider de nouvelles approches mieux ciblées pour contrôler ces pathogènes et les épidémies. Mon équipe réalise divers projets de caractérisation de nouveaux virus (virus émergents) et de virus réémergents.

Le Dr Nathalie Bissonnette oriente principalement ses activités de recherche sur l'immunogénétique de l’animal, l'immunotolérance et l'immunorégulation en réponse aux nutriments, à l’environnement, et aux contacts de pathogènes.

D^re Bouchard travaille en collaboration avec plusieurs chercheur(e)s sur les déterminants du risque associés à la maladie de Lyme et autres maladies transmises par les tiques  au Canada. Son travail consiste à comprendre où se retrouvent les tiques et plus particulièrement celles infectées par des agents microbiens pathogènes pour les humains et les animaux dans le contexte des changements climatiques. Elle s’intéresse et contribue depuis 2007 à la conception et à la réalisation d’activités de recherche, de surveillance et de contrôle de foyers émergents de la maladie de Lyme et autres maladies transmises par les tiques à travers le pays. D^re Bouchard s’intéresse plus particulièrement aux facteurs socio-comportementaux et environnementaux qui influencent le risque des maladies transmises par les tiques. Son expertise spécifique en analyse statistique et spatiale soutien ce dernier intérêt. Elle manifeste avoir trouvé son terrain de jeu, soit le domaine des maladies infectieuses à l’interface homme-animal-environnement.

Les objectifs du laboratoire de recherche sont de parfaire les connaissances sur les mécanismes de pathogenèse d’Escherichia coli entérotoxinogènes. En particulier, le rôle des toxines résistantes à la chaleur dans le déclenchement de diarrhée chez l’animal est étudié. Celles-ci sont des molécules de petits poids moléculaires et inclus les toxines STa et STb ainsi que la toxine EAST1 (enteroaggregative heat-stable toxin 1). Ces toxines sont impliquées dans des diarrhées aqueuses responsables de pertes économiques dues au retard de croissance, au traitement ainsi que, à certaines occasions, à la mortalité de l’animal. Nous nous intéressons à l’action de ces toxines sur les cellules de la muqueuse intestinale. Les expériences sont conduites à l’aide de cellules de petit intestin et de colon en culture. Nous étudions plus particulièrement l’effet de ces toxines sur les jonctions serrées qui pourrait expliquer, du moins en partie, la perte d’électrolytes et d’eau résultant d’intoxication avec les ETEC. L’effet de certaines molécules d’origine végétale sur la production et la toxicité de ces toxines est aussi au programme.

Ces études visent à mieux comprendre la pathologie observée ainsi que déterminer des méthodes pour prévenir les effets néfastes des toxines et/ou protéger à long terme, par la vaccination ou autre moyens les animaux.

• Surveillance des E.coli pathogènes chez les animaux et zoonotiques
• Influence des facteurs environnementaux sur les gènes de virulence et de résistance antimicrobienne d’E.coli dans l’écosystème intestinal de différentes espèces animales
• Identification de nouvelles adhésines fimbriaires
• Caractérisation du mécanisme d’attachement et d’effacement des E. coli d’origine animale
• Étude de la pathogénicité des E. coli
• Identification de facteurs de virulence d’E.coli causant la diarrhée post-sevrage chez le porc
• Vaccination et autres stratégies de prévention de la diarrhée post-sevrage associée à E.coli chez les animaux de production

• Recherche en détection et typage des pathogènes d’intérêt en hygiène alimentaire
• Caractérisation des écosystèmes microbiens des surfaces en agro-alimentaire
• Microbiologie des procédés industriels agro-alimentaires
• Programmes de surveillance et de maîtrise des pathogènes alimentaires dans les filières avicoles et porcines

Les maladies infectieuses animales et tout particulièrement les maladies virales porcines telles que le syndrome reproducteur et respiratoire porcin, les maladies associées au circovirus porcin et la grippe porcine. Certains projets de recherche du Dr Gagnon ciblent: 1) les mécanismes antiviraux et 2) la pathogenèse des infections animales mixtes (bactéries-virus, virus-virus) et donc qui étudient les interactions pathogènes-pathogènes. En tant que directeur scientifique du seul laboratoire universitaire québécois de diagnostic des maladies infectieuses virales animales, le Dr Gagnon réalise divers projets de caractérisation de nouveaux virus et de virus réémergents chez tous les animaux (domestiques, fermes, exotiques, faune).

Travaux sur la méningite causée par Streptococcus suis, un pathogène du porc (zoonose: transmise à l'Homme). Laboratoire de sérotypie: référence internationale. Laboratoire de diagnostic sérologique de la pleuropneumonie porcine (laboratoire de référence international).

Mon laboratoire s'intéresse aux facteurs de virulence des bactéries pathogènes. Nous nous intéressons plus particulièrement aux polysaccharides de surface et à leur implication dans la colonisation des muqueuses de l'hôte et la formation de biofilms. Nous utilisons comme modèle d'étude la bactérie Actinobacillus pleuropneumoniae responsable de la pleuropneumonie porcine et les staphylococques à coagulase négative isolés de mammite bovine.

Isolement, identification et caractérisation des bactéries pathogènes pour les différentes espèces animales

Le Dr Meurens a commencé sa carrière scientifique avec l’étude de la recombinaison génétique chez les alphaherpèsvirus de ruminants. Ensuite lors de ses recherches menées à VIDO-InterVac (Saskatoon), l’INRAE (Tours, France) et Oniris (Nantes, France) il a infléchi sa thématique vers l’hôte porcin en considérant différents agents pathogènes porcins et humains (salmonelles, colibacille, virus influenza, vSRRP, Entamoeba histolytica, Chlamydia trachomatis…). En immunologie il affectionne les questions relatives à l’immunité des muqueuses (surtout digestive et respiratoire) et aux réponses innées, chez le porc en tant qu’espèce cible et en tant qu’espèce d’intérêt biomédical. Toutes ces recherches sont menées dans l’optique de mieux traiter nos animaux et de réduire l’usage d’antimicrobiens.

Les recherches du Dr Ogden portent sur l’évaluation des risques en étudiant l’écologie, l’épidémiologie et la diversité génétique des vecteurs et des micro-organismes zoonotiques et à transmission vectorielle, l’évaluation des impacts des changements climatiques sur les zoonoses et les maladies à transmission vectorielle, et la création d’outils pour l’adaptation de la santé publique.

En tant que directeur de la division des sciences des risques pour la santé publique à l'Agence de la santé publique du Canada, il dirige des programmes sur l’évaluation des risques de maladies infectieuses basée sur des modèles, l’analyse épidémiologique avancée, la géomatique de la santé publique, l’épidémiologie moléculaire et la synthèse des connaissances. Les domaines d’intérêt comprennent les zoonoses, les maladies à transmission vectorielle, les maladies d’origine alimentaire et les effets des changements climatiques.

Étude des mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans la réponse immune innée et adaptative contre les polysaccharides capsulaires ou de surface de bactéries pathogènes extracellulaires. Plus précisément, la recherche vise à définir le rôle des cellules dendritiques (CDs) dans l’orchestration de ces réponses.

Ma recherche porte sur les pathogènes alimentaires, leur colonisation des animaux d’élevage et leur dissémination vers la population humaine.  Ma recherche porte autant sur la caractérisation des mécanismes propres aux pathogènes alimentaires qui leur permettent d’atteindre les humains que sur l’évolution de ces bactéries au sein des autres populations bactériennes qu’elles rencontrent;  j'observe et cherche à comprendre comment les autres bactéries peuvent influencer leur présence et surtout de quelle manière la composition de ce microbiote réagit lorsque l’on change les conditions d’élevage des animaux comme par exemple en modifiant la composition de leur nourriture en y ajoutant des huiles essentielles,  des acides organiques ou des probiotiques.

• Chimie structurale
• Résonance magnétique nucléaire
• Polysaccharides microbiens